Может ли плательщик налога на профессиональный доход выставить счет для оплаты индивидуальному предпринимателю или юридическому лицу?

Да, может. При этом, в Законе о настоящем эксперименте не указано использование счета на оплату товара или услуги.

 Функционал по выставлению счетов в приложении «Мой налог» в настоящее время не предусмотрен.